Muv-Luv ATE全名为《Muv-Luv Alternative Total eclipse 》，全集动画片改编自《Muv-Luv Alternative》的外传小说。故事的时间设定在西元2001年，由于人类遭到地球外起源种(联合国称其为BETA)的侵略，正面临灭亡的危机，因此人类开始了先进战术机技术开发计划“XFJ计划”，各个国家均派遣了专门人员参与其中，该作讲述的就是这些被派遣过来的人员之间的故事。（有虫子吃掉妹纸情节,反差极大,请谨慎观看.）
主人公小俊意外认识了来自马奇纳星球的警车机器人——炫蓝闪电，并得知地球上现在潜伏着很多来自马奇纳星球的炫卡斗士。为了地球的和平，勇敢的小俊和炫蓝闪电一起踏上了封装炫卡斗士的冒险旅途，寻求人类和炫卡斗士和谐共存的方式。小俊因此结识了各式各样的炫卡斗士，开展惊险刺激的冒险故事……
故事承接《鬼灭之刃 柱训练篇》。
男主角楚毅原是仙界最强狠人，但一次意外的渡劫失败让他回到过去曾经还是普通人时的日子。修仙大佬降临现代都市，成为一名普通底层打工人，既要老老实实上班，又要降维打击各路流氓恶霸，伸张正义，锄强扶弱，真是能力越大，责任越大。
江斩是《怪物杀戮手册》选中、激活“暗影君王”能力的自然觉醒者，以杀戮怪物晋升，人称“枯骨杀星”。他加入749局，与陈紫怡组队处理诡异事件，对抗怪物势力，揭开两界之谜，以极端手段重塑秩序，杀出自己的“朗朗乾坤”。
混杂于群众之中，以人类的肉为食。拥有人类的形态，却与人类不同的存在……“喰种”。在对“喰种”进行驱逐、研究的“CCG”，曾经率领“Quinx”小组的喰种搜查官“佐佐木琲世”。他正是行踪不明的眼罩喰种“金木研”。另一方面，在成立了新体制的“CCG”，以旧多二福为中心，不安定的行动终于表面化……与“金木研”有关的故事，终于迈向最终章——。
