故事设定在一个从未出现过奥特曼与怪兽的地球上。某天，一名外星人意外从宇宙坠落，他手持有着象征身份的红色宇宙回旋镖“奥美迦头镖”，并有着“究极”的称号。 失去过往记忆的外星人 “奥美迦” 化身为地球人模样，被人称为“宙人”。初到地球的宙人，对人类充满好奇，积极主动地接触和了解这些陌生的生命体。 当神秘巨型生物接连出现时，尘封的记忆碎片被唤醒，宙人认出这些生物正是记忆中的 “怪兽”。面对怪兽的威胁，强烈的使命感驱使他变身成为奥美迦奥特曼，与怪兽展开战斗。 与此同时，地球上的人类对突然现身的巨型生物，以及手持红色头镖与之战斗的巨人充满疑惑。为探寻真相，人类开始从各个角度观察这位神秘巨人。随着故事推进，来自外星的宙人与一位普通青年逐渐成为并肩作战的伙伴。作品将通过他们之间的羁绊与经历，深度探索 “奥特曼为何要守护地球” 这一问题的答案。 现在正是觉醒之时。
树乃仓厳，34岁。 一个孤独的露营爱好者，享受着独自一人的露营生活。 在一次露营结束后准备返回时，厳遇到了一个超新手的露营者——草野雫。 虽然厳一开始并不情愿，但他还是与雫一起开始了“二人独自露营”！ 厳安静的露营生活将会发生怎样的变化呢……
吉田是班上的班长。最近她最担心的事情，就是同班的矢野每天都会带着各种大大小小的伤口来学校。矢野总是弄伤自己，吉田根本没办法把目光从他身上移开！她迫切想为他处理伤口！这是一个关于满身是伤的男生和担心过头的女生的日常恋爱喜剧！
本片以巴斯德为核心，串联起动物学、植物学、古生物学、微生物学、生物医学及现代生物技术等相关学科的有趣知识。延续《我的牛顿教练》《门捷列夫很忙》等纪录片的动画表现风格，以生动、幽默的叙事手法，将更多的生物学知识普及给观众。
自从超大型巨人出现，人类的和平与幻想被打破的那天开始，艾伦·耶格尔无尽战斗的日子就未曾中断……。
